โรดานีส
| Rhodanese-like domain | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| ข้อมูลจำเพาะ | |||||||||
| สัญลักษณ์ | Rhodanese | ||||||||
| Pfam | PF00581 | ||||||||
| InterPro | IPR001763 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00322 | ||||||||
| SCOPe | 2ora / SUPFAM | ||||||||
| OPM superfamily | 413 | ||||||||
| OPM protein | 2mpn | ||||||||
| CDD | cd00158 | ||||||||
| Membranome | 571 | ||||||||
| |||||||||
โรดานีส (rhodanese) หรือชื่ออื่นคือ โรดาเนส (rhodanase), ไทโอซัลเฟตซัลเฟอร์ทรานสเฟอเรส (thiosulfate sulfurtransferase), ไทโอซัลเฟตไซยาไนด์ทรานส์ซัลฟูเรส (thiosulfate cyanide transsulfurase) และไทโอซัลเฟตไทโอทรานสเฟอเรส (thiosulfate thiotransferase)[1] เป็นเอนไซม์ที่อยู่ในไมโทคอนเดรียซึ่งล้างพิษไซยาไนด์ (CN−) โดยเปลี่ยนให้เป็นไทโอไซยาเนต (SCN−)[2]
การเกิดปฏิกริยา[แก้]
ปฏิกิริยานี้เกิดขึ้นในสองขั้นตอน ภาพประกอบแสดงการศึกษาโครงสร้างสามมิติด้วยรังสีเอกซ์ของผลึกโรดานีส ในขั้นตอนแรก ไทโอซัลเฟตถูกรีดิวซ์โดยหมู่ไทออลบนซิสเทอีน-247 เพื่อสร้างเพอร์ซัลไฟด์และซัลไฟต์ ในขั้นตอนที่สอง เพอร์ซัลไฟด์จะทำปฏิกิริยากับไซยาไนด์เพื่อผลิตไทโอไซยาเนต และสร้างหมู่ไทออลบนซิสเทอีนขึ้นใหม่[3]
ปฏิกิริยานี้มีความสำคัญต่อการบำบัดการสัมผัสกับไซยาไนด์ เนื่องจากไทโอไซยาเนตที่เกิดขึ้นมีความเป็นพิษประมาณ 1 ใน 200 ของไซยาไนด์[4]: 15938 การใช้สารละลายไทโอซัลเฟตเป็นยาแก้พิษจากไซยาไนด์อยู่บนฐานการกระตุ้นวงจรของเอนไซม์นี้
โรดานีสมีความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการร่วมกับตระกูลโปรตีนขนาดใหญ่รวมถึง
- โดเมนตัวเร่งปฏิกิริยา Cdc25 ฟอสฟาเตส
- โดเมนที่ไม่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาของ MAPK ฟอสฟาเตส
- โดเมนที่ไม่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาของ MAPK ฟอสฟาเตส ชนิด PTP ของยีสต์
- โดเมนที่ไม่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาของยีสต์ Ubp4, Ubp5, Ubp7
- โดเมนที่ไม่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาของสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม Ubp-Y
- ฮีตช็อกโปรตีนของแมลงหวี่ HSP-67BB
- โปรตีนฟาจช็อกและโคลช็อกของแบคทีเรียหลายชนิด
- โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการชราภาพของพืช
- โดเมนตัวเร่งปฏิกิริยาและไม่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาของโรดานีส[5]
โรดานีสมีการทำสำเนาภายใน โดเมนนี้พบเป็นสำเนาเดียวในโปรตีนอื่น ๆ รวมทั้งฟอสฟาเทส และยูบิควิตินซีไฮโดรเลส (Ubiquitin carboxy-terminal hydrolase)[6]
โปรตีนของมนุษย์ที่มีโดเมนนี้[แก้]
CDC25A; CDC25B; CDC25C; DUSP; DUSP1; DUSP10; DUSP16; DUSP2; DUSP4; DUSP5; DUSP6; DUSP7; KAT; MKP7; MOCS3; MPST; TBCK; TSGA14; TST; USP8
การตั้งชื่อ[แก้]
แม้ว่ากฎการตั้งชื่อมาตรฐานสำหรับเอนไซม์ระบุว่าชื่อจะต้องลงท้ายด้วยตัวอักษร "-ase" แต่โรดานีสได้รับการให้คำอธิบายครั้งแรกในปี พ.ศ. 2476[7] ก่อนการก่อตั้งคณะกรรมการเอนไซม์ซึ่งมีขึ้นในปี พ.ศ. 2498 ซึ่งชื่อโรดานีสมีการใช้งานอย่างแพร่หลายแล้ว
ไทโอซัลเฟตซัลเฟอร์ทรานสเฟอเรส[แก้]
| thiosulfate sulfurtransferase | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifiers | |||||||
| EC number | 2.8.1.1 | ||||||
| CAS number | 9026-04-4 | ||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||
| PRIAM | profile | ||||||
| PDB | structures | ||||||
| Gene Ontology | AmiGO / EGO | ||||||
| |||||||
ในวิทยาเอนไซม์ ไทโอซัลเฟตซัลเฟอร์ทรานสเฟอเรส (EC 2.8.1.1) เป็นเอนไซม์ที่ทำหน้าที่เร่งปฏิกิริยาเคมี
- ไทโอซัลเฟต + ไซยาไนด์ ซัลไฟต์ + ไทโอไซยาเนต
สารตั้งต้นของเอนไซม์นี้คือ ไทโอซัลเฟต และไซยาไนด์ ในขณะที่ผลิตภัณฑ์ทั้งสองคือ ซัลไฟต์ และไทโอไซยาเนต
การตั้งชื่อ[แก้]
เอนไซม์นี้เป็นตระกูลทรานสเฟอเรส ที่อยู่ในกลุ่มซัลเฟอร์ทรานสเฟอเรส ซึ่งถ่ายโอนกลุ่มที่มีกำมะถัน ชื่อในระบบการตั้งชื่อของเอนไซม์หมู่นี้คือ ไทโอซัลเฟต:ไซยาไนด์ซัลเฟอร์ทรานสเฟอเรส ชื่ออื่นที่ใช้ทั่วไปได้แก่ ไทโอซัลเฟตไซยาไนด์ทรานส์ซัลฟูเรส, ไทโอซัลเฟตไทโอทรานสเฟอเรส, โรดานีส และโรดาเนส
อ้างอิง[แก้]
- ↑ EC 2.8.1.1, at the International Union of Biochemistry and Molecular Biology
- ↑ Cipollone R, Ascenzi P, Tomao P, Imperi F, Visca P (2008). "Enzymatic detoxification of cyanide: clues from Pseudomonas aeruginosa Rhodanese". Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 15 (2–3): 199–211. doi:10.1159/000121331. PMID 18685272. S2CID 25431686.
- ↑ Cipollone R, Ascenzi P, Tomao P, Imperi F, Visca P (2008). "Enzymatic detoxification of cyanide: clues from Pseudomonas aeruginosa Rhodanese". Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. 15 (2–3): 199–211. doi:10.1159/000121331. PMID 18685272. S2CID 25431686.
- ↑ Jaszczak E, Polkowska Ż, Narkowicz S, Namieśnik J (July 2017). "Cyanides in the environment-analysis-problems and challenges". Environmental Science and Pollution Research International. 24 (19): 15929–15948. doi:10.1007/s11356-017-9081-7. PMC 5506515. PMID 28512706.
- ↑ "Thiosulphate sulfurtransferase, conserved site (IPR001307)". EMBL-EBI (ภาษาอังกฤษ). InterPro.
- ↑ Gliubich F, Gazerro M, Zanotti G, Delbono S, Bombieri G, Berni R (สิงหาคม 1996). "Active site structural features for chemically modified forms of rhodanese". The Journal of Biological Chemistry. 271 (35): 21054–61. doi:10.1074/jbc.271.35.21054. PMID 8702871.
- ↑ Cipollone R, Ascenzi P, Visca P (February 2007). "Common themes and variations in the rhodanese superfamily". IUBMB Life. 59 (2): 51–9. doi:10.1080/15216540701206859. PMID 17454295.
แหล่งข้อมูลอื่น[แก้]
- Rhodanese ในหอสมุดแพทยศาสตร์แห่งชาติอเมริกัน สำหรับหัวข้อเนื้อหาทางการแพทย์ (MeSH)