ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม
จากวิกิพีเดีย สารานุกรมเสรี
ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม (อังกฤษ: single-nucleotide polymorphism) หรือสนิป (อังกฤษ: SNP) เป็นการแปรผันของลำดับดีเอ็นเอชนิดหนึ่งซึ่งมีการเปลี่ยนแปลงของนิวคลีโอไทด์หนึ่งตัวในจีโนมทำให้แตกต่างจากจีโนมของสิ่งมีชีวิตอื่นในสปีชีส์เดียวกันหรือต่างจากโครโมโซมอีกแท่งหนึ่งในสิ่งมีชีวิตเดียวกัน ตัวอย่างเช่น ชิ้นส่วนดีเอ็นเอในตำแหน่งเดียวกันจากคนสองคนพบเป็น AAGCCTA และ AAGCTTA มีความแตกต่างที่นิวคลีโอไทด์ตัวหนึ่ง เช่นนี้กล่าวได้ว่า SNP นี้มี 2 อัลลีล โดย SNP ส่วนใหญ่มีเพียง 2 อัลลีลเท่านั้น
[แก้] แหล่งข้อมูลอื่น
- NCBI resources — Introduction to SNPs from NCBI
- The SNP Consortium LTD — SNP search
- NCBI dbSNP database — "a central repository for both single base nucleotide substitutions and short deletion and insertion polymorphisms"
- HGMD® — the Human Gene Mutation Database, includes rare mutations and functional SNPs
- SNPedia - a wiki devoted to the medical consequences of DNA variations, including software to analyze personal genomes
- International HapMap Project — "a public resource that will help researchers find genes associated with human disease and response to pharmaceuticals"
- GWAS Central — a central database of summary-level genetic association findings
- 1000 Genomes Project — A Deep Catalog of Human Genetic Variation
- SIFT — "An online tool that predicts on the effect of SNPs on protein function"
- WatCut — an online tool for the design of SNP-RFLP assays
- SNPStats — SNPStats, a web tool for analysis of genetic association studies
- Restriction HomePage — a set of tools for DNA restriction and SNP detection, including design of mutagenic primers
- American Association for Cancer Research Cancer Concepts Factsheet on SNPs
- PharmGKB — The Pharmacogenetics and Pharmacogenomics Knowledge Base, a resource for SNPs associated with drug response and disease outcomes.
- GEN-SNiP — Online tool that identifies polymorphisms in test DNA sequences.
- Online tool that predicts on the effects of SNPs on protein function
- Rules for Nomenclature of Genes, Genetic Markers, Alleles, and Mutations in Mouse and Rat
- HGNC Guidelines for Human Gene Nomenclature
- SNP effect predictor with galaxy integration
|
|||||||||||||||||
