ผลต่างระหว่างรุ่นของ "ผับเคม"
เนื้อหาที่ลบ เนื้อหาที่เพิ่ม
ล บอตแก้คำ |
ล wikify |
||
บรรทัด 1: | บรรทัด 1: | ||
{{ชื่ออังกฤษ}} |
|||
{{ช่วยดูหน่อย}} |
|||
[[Image:Pubchemlogo.png|PubChem logo|right]] |
[[Image:Pubchemlogo.png|PubChem logo|right|สัญลักษณ์ PubChem]] |
||
'''PubChem''' เป็น [[ฐานข้อมูล]] ของ [[โมเลกุล]] [[เคมี]] ระบบนี้ถูกดูแลรักษาโดย [[ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ]] (National Center for Biotechnology Information-NCBI) ซึ่งเป็นของ [[สถาบันสุขภาพแห่งชาติ ]] (National Institutes of Health-NIH) ของ [[ประเทศสหรัฐอเมริกา]] PubChem ให้บริการฟรีโดยผ่าน [[เว็บยูสเวอร์อินเตอร์เฟซ]] (web user interface) PubChem จะมีข้อมูลส่วนใหญ่ของโมเลกุลขนาดเล็กซึ่งมี [[น้ำหนักโมเลกุล]] ต่ำกว่า 500 [[สมาคมเคมีอเมริกัน]] (American Chemical Society) พยายามขอร้องให้ [[รัฐสภาอเมริกัน]] จำกัดการปฏิบัติงานของ PubChem เพราะไปก้าวก่ายงาน [[บริการบทคัดย่อทางเคมี]] (Chemical Abstracts Service) ของสมาคม[http://osc.universityofcalifornia.edu/news/acs_pubchem.html]. |
'''PubChem''' เป็น [[ฐานข้อมูล]] ของ [[โมเลกุล]] [[เคมี]] ระบบนี้ถูกดูแลรักษาโดย [[ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ]] (National Center for Biotechnology Information-NCBI) ซึ่งเป็นของ [[สถาบันสุขภาพแห่งชาติ ]] (National Institutes of Health-NIH) ของ [[ประเทศสหรัฐอเมริกา]] PubChem ให้บริการฟรีโดยผ่าน [[เว็บยูสเวอร์อินเตอร์เฟซ]] (web user interface) PubChem จะมีข้อมูลส่วนใหญ่ของโมเลกุลขนาดเล็กซึ่งมี [[น้ำหนักโมเลกุล]] ต่ำกว่า 500 [[สมาคมเคมีอเมริกัน]] (American Chemical Society) พยายามขอร้องให้ [[รัฐสภาอเมริกัน]] จำกัดการปฏิบัติงานของ PubChem เพราะไปก้าวก่ายงาน [[บริการบทคัดย่อทางเคมี]] (Chemical Abstracts Service) ของสมาคม[http://osc.universityofcalifornia.edu/news/acs_pubchem.html]. |
||
== ฐานข้อมูล == |
== ฐานข้อมูล == |
||
PubChem ประกอบด้วย 3 ฐานข้อมูลขั้นพื้นฐาน: |
PubChem ประกอบด้วย 3 ฐานข้อมูลขั้นพื้นฐาน: |
||
* สารประกอบ (Compounds) 5.2 ล้านข้อมูล ประกอบด้วยสารประกอบเคมีบริสุทธ์และสารประกอบเฉพาะ |
* สารประกอบ (Compounds) 5.2 ล้านข้อมูล ประกอบด้วยสารประกอบเคมีบริสุทธ์และสารประกอบเฉพาะ |
||
* สสาร (Substances) 7.7 ล้านข้อมูล ประกอบด้วย ของผสม [[สารสกัด]] (extract) [[สารประกอบเชิงซ้อน]] (complexes) และสารประกอบทั่วไป |
* สสาร (Substances) 7.7 ล้านข้อมูล ประกอบด้วย ของผสม [[สารสกัด]] (extract) [[สารประกอบเชิงซ้อน]] (complexes) และสารประกอบทั่วไป |
||
* รายงานการวิเคราะห์ทางชีวภาพ (BioAssay) [[กิจกรรมทางชีวภาพ]] (bioactivity) ที่เป็นผลจาก 176 โปรแกรม |
* รายงานการวิเคราะห์ทางชีวภาพ (BioAssay) [[กิจกรรมทางชีวภาพ]] (bioactivity) ที่เป็นผลจาก 176 โปรแกรม |
||
== Searching == |
|||
Searching the databases is possible for a broad range of properties including chemical structure, name fragments, [[chemical formula]], [[Molecular mass|molecular weight]], [[XLogP]], and [[hydrogen bond]] donor and acceptor count. |
|||
PubChem contains an own online [[molecule editor]] with [[Simplified molecular input line entry specification|SMILES]]/SMARTS and [[International Chemical Identifier|InChI]] support that allows the import and export of all common chemical file formats to search for structures and fragments. |
|||
Each hit provides information about synonyms, chemical properties, chemical structure including SMILES and InChI strings, bioactivity, and links to structurally related compounds and other NCBI databases like [[PubMed]]. |
|||
In the text search form the database fields can be searched by adding the field name in square brackets to the search term. A numeric range is represented by two numbers separated by a colon. The search terms and field names are case-insensitive. Parentheses and the [[logical operator]]s AND, OR, and NOT can be used. AND is assumed if no operator is used. |
|||
Example ([[Lipinski's Rule of Five]]): |
|||
0:500[mw] 0:5[hbdc] 0:10[hbac] -5:5[logp]---> |
|||
== ขอบเขตฐานข้อมูล == |
== ขอบเขตฐานข้อมูล == |
||
{| |
{| |
||
|- |
|- |
||
บรรทัด 105: | บรรทัด 89: | ||
|- |
|- |
||
|} |
|} |
||
== ดูเพิ่ม == |
|||
* [[Chemical database]] |
|||
* [[National Center for Biotechnology Information]] (NCBI) |
|||
* [[Entrez]] |
|||
* [[PubMed]] |
|||
* [[GenBank]] |
|||
* [[Chemistry resources]] |
|||
== ลิงก์ภายนอก == |
== ลิงก์ภายนอก == |
||
⚫ | |||
{{โครงเคมี}} |
|||
* [http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov PubChem homepage] |
|||
* [http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/search/ PubChem searchpage] |
|||
⚫ | |||
* [http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/help.html PubChem Help] |
|||
[[Category:เคมี]] |
[[Category:เคมี]] |
||
รุ่นแก้ไขเมื่อ 06:50, 15 มีนาคม 2549
บทความนี้มีชื่อเป็นภาษาอังกฤษ เนื่องจากยังไม่มีชื่อภาษาไทยที่กระชับ เหมาะสม, ไม่ปรากฏคำอ่านที่แน่ชัด หรือไม่ปรากฏคำแปลที่ใช้ในทางวิชาการ |
PubChem เป็น ฐานข้อมูล ของ โมเลกุล เคมี ระบบนี้ถูกดูแลรักษาโดย ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ (National Center for Biotechnology Information-NCBI) ซึ่งเป็นของ สถาบันสุขภาพแห่งชาติ (National Institutes of Health-NIH) ของ ประเทศสหรัฐอเมริกา PubChem ให้บริการฟรีโดยผ่าน เว็บยูสเวอร์อินเตอร์เฟซ (web user interface) PubChem จะมีข้อมูลส่วนใหญ่ของโมเลกุลขนาดเล็กซึ่งมี น้ำหนักโมเลกุล ต่ำกว่า 500 สมาคมเคมีอเมริกัน (American Chemical Society) พยายามขอร้องให้ รัฐสภาอเมริกัน จำกัดการปฏิบัติงานของ PubChem เพราะไปก้าวก่ายงาน บริการบทคัดย่อทางเคมี (Chemical Abstracts Service) ของสมาคม[1].
ฐานข้อมูล
PubChem ประกอบด้วย 3 ฐานข้อมูลขั้นพื้นฐาน:
- สารประกอบ (Compounds) 5.2 ล้านข้อมูล ประกอบด้วยสารประกอบเคมีบริสุทธ์และสารประกอบเฉพาะ
- สสาร (Substances) 7.7 ล้านข้อมูล ประกอบด้วย ของผสม สารสกัด (extract) สารประกอบเชิงซ้อน (complexes) และสารประกอบทั่วไป
- รายงานการวิเคราะห์ทางชีวภาพ (BioAssay) กิจกรรมทางชีวภาพ (bioactivity) ที่เป็นผลจาก 176 โปรแกรม
ขอบเขตฐานข้อมูล
Identification numbers | ||
• | Identification number in current database | [UID] |
• | Substance identification number | [SID] |
• | Compound identification number | [CID] |
• | BioAssay identification number | [BAID], [AID] |
General | ||
• | Any database field | [ALL] |
• | Comment | [CMT] |
• | Deposition date | [DDAT], [DEPDAT] |
• | Depositor's external ID | [SRID], [SRCID] |
• | Source name | [SRC], [SRCNAM], [SRCNAME] |
• | Source release date | [SRD], [SRDAT], [RLSDAT] |
• | Medical Subject Heading (MeSH) term | [MSHT], [MESHT] |
• | MeSH tree node | [MSHN], [MESHTN] |
• | MeSH pharmacological actions | [PHMA], [PHARMA] |
Substance properties | ||
• | Substance synonyms | [SYNO] |
• | IUPAC name | [UPAC], [IUPAC] |
• | International Chemical Identifier (InChI) | [INCHI] |
• | Molecular weight | [MW], [MWT], [MOLWT] |
• | Chemical elements | [ELMT], [EL] |
• | Non-Hydrogen atoms | [HAC], [HACNT] |
• | Isotope count | [IAC], [IACNT] |
• | Total formal charge | [TFC], [CHG], [CHRG] |
• | Chiral atom count | [ACC], [ACCNT] |
• | Defined chiral atom count | [ACDC], [ACDCNT] |
• | Undefined chiral atom count | [ACUC], [ACUCNT] |
• | Hydrogen bond acceptor count | [HBAC], [HBACNT] |
• | Hydrogen bond donor count | [HBDC], [HBDCNT] |
• | Tautomer count | [TC], [TCNT], [TTMC] |
• | Rotatable bond count | [RBC], [RBCNT] |
• | XLogP | [XLGP], [LOGP] |
Compound properties | ||
• | Compound synonyms | [CSYN], [CSYNO] |
• | Component count | [CC], [CCNT] |
• | Covalent unit (molecule) count | [CUC], [CUCNT] |
• | Total bioactivity count | [TAC] |