Turicibacter
 | บทความนี้อาจต้องการตรวจสอบต้นฉบับสำหรับไวยากรณ์ รูปแบบการเขียน การเรียบเรียง คุณภาพ หรือการสะกด |
| Turicibacter | |
|---|---|
 | |
| เซลล์ของ Turicibacter sp. H121 ภายใต้กล้องจุลทรรศน์ | |
 | |
| กลุ่มเชื้อ Turicibacter sp. H121 | |
การจำแนกชั้นทางวิทยาศาสตร์  | |
| โดเมน: | แบคทีเรีย Bacteria |
| อาณาจักร: | Bacillati |
| ไฟลัม: | Bacillota |
| ชั้น: | Erysipelotrichia |
| อันดับ: | Erysipelotrichales |
| วงศ์: | Turicibacteraceae Turicibacteraceae Verbarg et al. 2020 |
| สกุล: | Turicibacter Turicibacter Bosshard, Zbinden & Altwegg 2002 |
| ชนิดต้นแบบ | |
| Turicibacter sanguinis Bosshard, Zbinden & Altwegg 2002 | |
| ชนิดพันธุ์[1] | |
Turicibacter เป็นแบคทีเรียสกุลหนึ่งในไฟลัม Bacillota ที่พบได้ทั่วไปในลำไส้ของสัตว์[2] สกุลนี้ตั้งชื่อตามเมืองแรกที่แยกเชื้อนี้ออกมาจากโลหิตของมนุษย์คือเมืองซือริช (ละติน: Turicum) ประเทศสวิตเซอร์แลนด์[3]
วิวัฒนาการ
[แก้]ลำดับอนุกรมวิธานของ Turicibacter ภายในไฟลัม Bacillota ไม่สามารถระบุได้ด้วยการวิเคราะห์ยีน 16S rRNA อย่างไรก็ตามได้ถูกจัดอยู่ในชั้น Bacilli และต่อมาอยู่ในชั้น Erysipelotrichia[4]
ในแผนผังที่สร้างขึ้นโดยใช้การจัดเรียงโปรตีนที่เชื่อมกันซึ่งประกอบด้วยข้อมูลจากจีโนม Turicibacter ฉบับร่างสองจีโนม ถูกจัดกลุ่มอยู่ในชั้น Bacilli[5] การวิเคราะห์ในภายหลังซึ่งรวมถึงลำดับกรดอะมิโนที่ทำนายโดยจีโนม Turicibacter ที่สมบูรณ์ก็ได้ข้อสรุปเดียวกันนี้[2]
อนุกรมวิธานที่ได้รับการยอมรับในปัจจุบันอ้างอิงจากฐานข้อมูลออนไลน์ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1] และศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติสหรัฐ (NCBI)[6]
| การวิเคราะห์ยีน 16S rRNA (LTP_10_2024)[7][8][9] | การวิเคราะห์โปรตีนมาตรฐาน 120 ชนิด (GTDB 09-RS220)[10][11][12] | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
อ้างอิง
[แก้]- 1 2 A.C. Parte; และคณะ. "Turicibacter". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). สืบค้นเมื่อ 28 กุมภาพันธ์ 2025.
- 1 2 Auchtung TA, Holder ME, Gesell JR, Ajami NJ, Duarte RT, Itoh K, Caspi RR, Petrosino JF, Horai R, Zárate-Bladés CR (2016). "Complete Genome Sequence of Turicibacter sp. Strain H121, Isolated from the Feces of a Contaminated Germ-Free Mouse". Genome Announcements. 4 (2): e00114-16. doi:10.1128/genomeA.00114-16. PMC 4807225. PMID 27013036.
- ↑ Bosshard PP, Zbinden R, Altwegg M (2002). "Turicibacter sanguinis gen. nov., sp. nov., a novel anaerobic, Gram-positive bacterium". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52: 1263–1266. doi:10.1099/00207713-52-4-1263. PMID 12148638.
- ↑ Bosshard PP. "Genus VIII. Turicibacter Bosshard, Zbinden and Altwegg 2002, 1266VP". ใน De Vos P, Garrity GM, Jones D, Krieg NR, Ludwig W, Rainey FA, Schleifer K, Whitman WB (บ.ก.). Bergey’s manual of systematic bacteriology, 2nd ed. The Firmicutes. Springer. น. 1314–1315.
- ↑ Segata N, Börnigen D, Morgan XC, Huttenhower C (2013). "PhyloPhlAn is a new method for improved phylogenetic and taxonomic placement of microbes". Nature Communications. 4: 2304. doi:10.1038/ncomms3304. PMC 3760377. PMID 23942190.
- ↑ C.L. Schoch; และคณะ. "Turicibacter". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. สืบค้นเมื่อ 28 กุมภาพันธ์ 2025.
- ↑ "The LTP". สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.
- ↑ "LTP_all tree in newick format". สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.
- ↑ "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF). สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.
- ↑ "GTDB release 09-RS220". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 10 พฤษภาคม 2024.
- ↑ "bac120_r220.sp_labels". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 10 พฤษภาคม 2024.
- ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 10 พฤษภาคม 2024.