Jmol
mol_logo_2013.svg){kind=logo} | |
 Jmol three-dimensional structure rendering of streptavidin | |
| นักพัฒนา | Jmol development team |
|---|---|
| วันที่เปิดตัว | 2001 |
| รุ่นเสถียร | 16.4.3 
/ 27 พฤษภาคม 2026 |
| ที่เก็บข้อมูล | jmol |
| ภาษาที่เขียน | Java |
| ระบบปฏิบัติการ | Cross-platform |
| แพลตฟอร์ม | Systems with Java and Web browsers without Java |
| ภาษา | 24 ภาษา |
รายชื่อภาษา Basque, Catalan, Chinese (CN and TW), Czech, Danish, Dutch, English (GB and US), Finnish, French, German, Hungarian, Indonesian, Italian, Japanese, Korean, Malay, Portuguese (BR), Russian, Spanish, Swedish, Turkish and Ukrainian [1] | |
| ประเภท | Molecular modelling |
| สัญญาอนุญาต | LGPL 2.0 |
| เว็บไซต์ | www |
Jmol คือซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์สำหรับสร้างแบบจำลองโมเลกุลของโครงสร้างทางเคมีในรูปแบบ 3 มิติ[2] เป็น โปรแกรมดูภาพโครงสร้างทางเคมี 3 มิติ โอเพนซอร์สที่เขียนด้วยภาษาจาวา[3] ชื่อนี้มีที่มาจาก [J]ava (ภาษาโปรแกรม) + [mol]ecules (โมเลกุล) และสอดคล้องกับนามสกุลไฟล์โครงสร้างเคมีมาตรฐาน .mol ด้วย
JSmol เป็นการนำฟังก์ชันการทำงานของ Jmol มาใช้ใน JavaScript [4] ลงในหน้าเว็บไซต์เพื่อแสดงแบบจำลอง 3 มิติแบบโต้ตอบของโมเลกุลและโครงสร้างอื่น ๆ โดยไม่ต้องใช้ซอฟต์แวร์ใดนอกจากเว็บเบราว์เซอร์ (ไม่ได้ใช้จาวา)
ทั้ง Jmol และ JSmol นำเสนอภาพ 3 มิติแบบโต้ตอบของโมเลกุล หรือโครงสร้างอื่น ๆ สามารถใช้เป็นเครื่องมือการสอน[5] หรือเพื่อการวิจัยในหลายสาขา เช่น เคมี ชีวเคมี วัสดุสศาสตร์ ผลิกศาสตร์[6] สมมาตร หรือนาโนเทคโนโลยี ได้
ภาพหน้าจอ
[แก้]
ระนาบโปร่งแสงสองแผ่นแสดงระนาบสมมาตรของโมเลกุลน้ำ
แผนที่ศักย์ไฟฟ้าสถิตของอัลลีนที่แสดงบนพื้นผิวโปร่งแสง
ภาพแสดงเงาของคาเฟอีน พร้อมด้วยการวัดบางส่วน (ระยะทาง มุม มุม ไดเฮดรัล )
ภาพเคลื่อนไหวแสดง ปฏิกิริยา SN2 โดยแสดงระยะห่างที่วัดได้ระหว่างอะตอมคลอรีนและคาร์บอน
ภาพแสดงโครงสร้างผลึกควอตซ์ โดยบรรจุอยู่ในเซลล์หน่วย 2×2×2 มีการวาดกรอบขอบเขตของเซลล์หน่วย และข้อมูลของเซลล์หน่วยแสดงอยู่ทางด้านซ้ายบน
ภาพการ์ตูน ออร์บิทัลพี ของเบนซีน พร้อมด้วย ออร์บิทัลโมเลกุลโปร่งแสงที่สอดคล้องกัน
โครงสร้างผลึกของ H/ACA box RNP จาก Pyrococcus furiosus
ภาพแสดงสะพานเกลือ สองพันธะใน ฮีโมโกลบิน เตตระเมอร์ (กลุ่มฮีโมแสดงเป็นแท่งที่มุมล่างขวา)
ชิ้นส่วนของปัจจัยการถอดรหัส TFIIIA ที่ประกอบด้วย Zinc Finger สามชุด จับกับสายดีเอ็นเอ
ไรโบโซม 70S ของยูแบคทีเรีย จาก Thermus thermophilus
อ้างอิง
[แก้]- ↑ Jmol translations
- ↑ Chen, Jim X. (2008), Springer (บ.ก.), Guide to Graphics Software Tools, p. 471, ISBN 978-1-84800-900-4
- ↑ "How to cite Jmol".
- ↑ "JSmol". สืบค้นเมื่อ 2025-01-11.
- ↑ Herráez, A (2006), "Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue", Biochemistry and Molecular Biology Education, vol. 34 no. 4, pp. 255–61, doi:10.1002/bmb.2006.494034042644, PMID 21638687
- ↑ Hanson, Robert M. (2010), "Jmol – a paradigm shift in crystallographic visualization", Journal of Applied Crystallography, vol. 43 no. 5, pp. 1250–1260, doi:10.1107/S0021889810030256
แหล่งข้อมูลอื่น
[แก้]- การสาธิตความสามารถของ JSmol หน้าเว็บอย่างง่ายที่มีการสาธิตแบบโต้ตอบของฟีเจอร์ต่างๆ ของ JSmol ฝังอยู่ในหน้าเว็บ
- เว็บไซต์ Jmol (เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ แต่ข้อมูลอาจไม่สมบูรณ์)
- Jmol Wiki (ใช้งานได้และอัปเดตอยู่เสมอ) ซึ่งมีข้อมูลมากมาย รวมถึงรายชื่อ เว็บไซต์ วิกิ และ Moodle
- Hanson, Robert M.; Prilusky, Jaime; Renjian, Zhou; Nakane, Takanori; Sussman, Joel L. (2013). "JSmol and the next-generation web-based representation of 3D molecular structure as applied to Proteopedia". Israel Journal of Chemistry. doi:10.1002/ijch.201300024.
- ส่วนขยาย Jmol ใน MediaWiki
- ส่วนขยาย Jmol สำหรับ MediaWiki ที่ SourceForge
- ส่วนขยาย Jmol สำหรับ MediaWiki ที่ JmolWiki
- Proteopedia - ชีวิตในรูปแบบ 3 มิติ สารานุกรม 3 มิติแบบร่วมมือและฟรีเกี่ยวกับโปรตีนและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ (ใช้ Jmol Extension เป็นส่วนประกอบหลัก)
- แบบจำลอง Biomodel ช่วยเสริมการเรียนรู้ชีวเคมีและชีววิทยาระดับโมเลกุล
- Molview