ข้ามไปเนื้อหา

Aquificota

จากวิกิพีเดีย สารานุกรมเสรี

Aquificota
การจำแนกชั้นทางวิทยาศาสตร์ แก้ไขการจำแนกนี้
โดเมน: แบคทีเรีย
Bacteria
อาณาจักร: Pseudomonadati
ไฟลัม: Aquificota
Reysenbach 2021[1]
ชั้น
ชื่อพ้อง
  • "Aquificae" Reysenbach 2001
  • "Aquithermota" Cavalier-Smith 2020
  • "Aquificota" Whitman et al. 2018
  • "Aquificaeota" Oren et al. 2015

ไฟลัม Aquificota เป็นกลุ่มแบคทีเรียที่มีความหลากหลายซึ่งอาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่รุนแรง[2][3] ชื่อ Aquificota ได้รับการตั้งให้กับไฟลัมนี้ โดยอิงจากสกุลแรก ๆ ที่ระบุภายในกลุ่มนี้ คือ Aquifex (“ผู้สร้างน้ำ”) ซึ่งสามารถผลิตน้ำได้โดยการออกซิไดซ์ไฮโดรเจน[4] พบได้ในน้ำพุ สระน้ำ และมหาสมุทร พวกมันเป็นสิ่งมีชีวิตสร้างอาหารเองได้ และเป็นผู้ตรึงคาร์บอนหลักในสภาพแวดล้อมของพวกมัน แบคทีเรียเหล่านี้เป็นแบคทีเรียแกรมลบรูปแท่งที่ไม่สร้างสปอร์[5] ถือเป็นแบคทีเรียแท้ (โดเมนแบคทีเรีย) ซึ่งแตกต่างจากสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ ที่อาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมสุดขั้วอย่างอาร์เคีย

อนุกรมวิธาน

[แก้]

ปัจจุบัน Aquificota มี 15 สกุล และ 42 ชนิดพันธุ์ที่ได้รับการตีพิมพ์อย่างถูกต้อง[6] ไฟลัมนี้แบ่งออกเป็นสามชั้น แต่ละชั้นมีอันดับเป็นของตนเอง[7][8] Aquificales ประกอบด้วยวงศ์ Aquificaceae และ Hydrogenothermaceae ส่วน Desulfurobacteriaceae เป็นเพียงวงศ์เดียวใน Desulfurobacteriales และ Thermosulfidibacter takaii ไม่ได้ถูกจัดให้อยู่ในวงศ์ใดวงศ์หนึ่งภายในไฟลัม โดยพิจารณาจากความแตกต่างทางด้านวิวัฒนาการจากทั้งสองอันดับ[9] ปัจจุบันจัดอยู่ในกลุ่ม Aquificales แต่พบว่ามีลักษณะทางสรีรวิทยาคล้ายคลึงกับ Desulfobacteriaceae มากกว่า

วิวัฒนาการชาติพันธุ์

[แก้]

อนุกรมวิธานที่ได้รับการรับรองในปัจจุบันอิงจาก List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[10] และ National Center for Biotechnology Information (NCBI).[11][12]

16S rRNA อิงจาก LTP_10_2024[13][14][15] เครื่องหมายระบุโปรตีน 120 อันอิงจาก GTDB 10-RS226[16][17][18]
Thermosulfidibacterales

Thermosulfidibacteraceae

Thermosulfidibacterota
Thermosulfidibacteria
Thermosulfidibacterales

Thermosulfidibacteraceae Chuvochina et al. 2024

Aquificota
Aquificia
Desulfurobacteriales

Desulfurobacteriaceae L'Haridon et al. 2006

Aquificales

Hydrogenothermaceae Eder and Huber 2003

Aquificaceae Reysenbach 2002

อ้างอิง

[แก้]
  1. Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
  2. Griffiths E, Gupta RS (มกราคม 2006). "Molecular signatures in protein sequences that are characteristics of the phylum Aquificae". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 1): 99–107. doi:10.1099/ijs.0.63927-0. PMID 16403873.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  3. Horiike T, Miyata D, Hamada K, และคณะ (มกราคม 2009). "Phylogenetic construction of 17 bacterial phyla by new method and carefully selected orthologs". Gene. 429 (1–2): 59–64. doi:10.1016/j.gene.2008.10.006. PMC 2648810. PMID 19000750.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  4. Huber R, Wilharm T, Huber D, Trincone A, Burggaf S, Konig H, Reinhard R, Rockinger I, Fricke H, Stetter K (1992). "Aquifex pyrophilus gen. nov. sp. nov., Represents a Novel Group of Marine Hyperthermophilic Hydrogen-Oxidizing Bacteria". Syst. Appl. Microbiol. 15 (3): 340–351. doi:10.1016/S0723-2020(11)80206-7.
  5. L'Haridon, Reysenbach AL, Tindall BJ, Schönheit P, Banta A, Johnsen U, Schumann P, Gambacorta A, Stackebrandt E, Jeanthon C (ธันวาคม 2006). "Desulfurobacterium atlanticum sp. nov., Desulfurobacterium pacificum sp. nov. and Thermovibrio guaymasensis sp. nov., three thermophilic members of the Desulfurobacteriaceae fam. nov., a deep branching lineage within the bacteria" (PDF). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 12): 2843–2852. doi:10.1099/ijs.0.63994-0. PMID 17158986.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  6. J.P. Euzéby. "Aquificae". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). ข้อมูลเก่าจากต้นฉบับ เมื่อ 2011-06-13. สืบค้นเมื่อ 2016-09-09.
  7. Oren A, Garrity GM (2015). "List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 65 (7): 2017–2025. doi:10.1099/ijs.0.000317. PMC 5817221. PMID 28891789.
  8. Gupta RS, Lali R (กันยายน 2013). "Molecular signatures for the phylum Aquificae and its different clades: Proposal for division of the phylum Aquificae into the emended order Aquificales, containing the families Aquificaceae and Hydrogenothermaceae, and a new order Desulfurobacteriales ord. nov., containing the family Desulfurobacteriaceae". Antonie van Leeuwenhoek. 104 (3): 349–368. doi:10.1007/s10482-013-9957-6. PMID 23812969. S2CID 559778.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  9. Nunoura T, Oida H, Miyazaki M, Suzuki Y (มีนาคม 2008). "Thermosulfidibacter takaii gen. nov., sp. nov., a thermophilic, hydrogen-oxidizing, sulfur-reducing chemolithoautotroph isolated from a deep-sea hydrothermal field in the Southern Okinawa Trough". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 58 (Pt 3): 659–665. doi:10.1099/ijs.0.65349-0. PMID 18319474.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  10. Aquificota in LPSN; Freese, H. M.; Meier-Kolthoff, J. P.; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, A. O.; Göker, M. (29 ตุลาคม 2025). "TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome-based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity". Nucleic Acids Research. 53: D1–D12. doi:10.1093/nar/gkaf1110.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  11. Schoch CL; และคณะ. "Aquificota". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. สืบค้นเมื่อ 2025-06-05.
  12. Ludwig, W.; Euzéby, J. & Whitman W.B. (2008). "Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes" (PDF). Bergey's Manual Trust: 15. ข้อมูลเก่าจากต้นฉบับ (PDF) เมื่อ 2009-04-24. สืบค้นเมื่อ 2011-06-27.
  13. "The LTP". สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  14. "LTP_all tree in newick format". สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  15. "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF). สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  16. "GTDB release 10-RS226". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 1 พฤษภาคม 2025.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  17. "bac120_r226.sp_label". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 1 พฤษภาคม 2025.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  18. "Taxon History". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 1 พฤษภาคม 2025.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)